Seit über 40 Jahren ist die Werkself fester Bestandteil der Fußball-Bundesliga. Die Rot-Schwarzen stehen für attraktiven Offensivfußball, häufig gute Einkäufe aus dem Ausland - aber auch für fehlende Liga-Titel.
Zu den größten Erfolgen des Klubs zählen der Sieg im UEFA-Pokal 1988 und der Gewinn des DFB-Pokals 1993 sowie das Erreichen des Champions-League-Finales 2002. Nur auf eine Meisterschaft warten die Fans von Bayer 04 bis heute vergebens.